Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXA7
Ідентифікатори
Символи
HOXA7 , ANTP, HOX1, HOX1.1, HOX1A, homeobox A7
Зовнішні ІД
OMIM : 142950 MGI: 96179 HomoloGene: 56001 GeneCards: HOXA7
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерна мембрана
Біологічний процес
• embryonic skeletal system morphogenesis • negative regulation of monocyte differentiation • negative regulation of keratinocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • stem cell differentiation • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell-matrix adhesion • multicellular organism development • Ангіогенез • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of leukocyte migration • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 27.15 – 27.16 Mb
Хр. 6: 52.19 – 52.2 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HOXA7 (англ. Homeobox A7 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 230 амінокислот , а молекулярна маса — 25 355[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSSSYYVNAL FSKYTAGASL FQNAEPTSCS FAPNSQRSGY GAGAGAFAST
VPGLYNVNSP LYQSPFASGY GLGADAYGNL PCASYDQNIP GLCSDLAKGA
CDKTDEGALH GAAEANFRIY PWMRSSGPDR KRGRQTYTRY QTLELEKEFH
FNRYLTRRRR IEIAHALCLT ERQIKIWFQN RRMKWKKEHK DEGPTAAAAP
EGAVPSAAAT AAADKADEED DDEEEEDEEE
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
La Celle P.T., Polakowska R.R. (2001). Human homeobox HOXA7 regulates keratinocyte transglutaminase type 1 and inhibits differentiation. J. Biol. Chem . 276 : 32844—32853. PMID 11435435 DOI :10.1074/jbc.M104598200
Kim M.H., Jin H., Seol E.Y., Yoo M., Park H.W. (2000). Sequence analysis and tissue specific expression of human HOXA7. Mol. Biotechnol . 14 : 19—24. PMID 10911612 DOI :10.1385/MB:14:1:19
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші