Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ID4
Ідентифікатори
Символи
ID4 , IDB4, bHLHb27, inhibitor of DNA binding 4, HLH protein
Зовнішні ІД
OMIM : 600581 MGI: 99414 HomoloGene: 1186 GeneCards: ID4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• protein dimerization activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• prostate gland stromal morphogenesis • negative regulation of fat cell differentiation • negative regulation of astrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • central nervous system myelination • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • seminal vesicle morphogenesis • brain development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of osteoblast differentiation • prostate gland epithelium morphogenesis • negative regulation of oligodendrocyte differentiation • циркадний ритм • positive regulation of cell population proliferation • prostate gland morphogenesis • neuroblast proliferation • cerebral cortex neuron differentiation • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • hippocampus development • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • G1/S transition of mitotic cell cycle • neuron differentiation • negative regulation of DNA binding • regulation of cell cycle • osteoblast differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 19.84 – 19.84 Mb
Хр. 13: 48.41 – 48.42 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ID4 (англ. Inhibitor of DNA binding 4, HLH protein ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 161 амінокислот , а молекулярна маса — 16 622[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKAVSPVRPS GRKAPSGCGG GELALRCLAE HGHSLGGSAA AAAAAAAARC
KAAEAAADEP ALCLQCDMND CYSRLRRLVP TIPPNKKVSK VEILQHVIDY
ILDLQLALET HPALLRQPPP PAPPHHPAGT CPAAPPRTPL TALNTDPAGA
VNKQGDSILC R
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Локалізований у ядрі .
Pagliuca A., Bartoli P.C., Saccone S., Della Valle G., Lania L. (1995). Molecular cloning of ID4, a novel dominant negative helix-loop-helix human gene on chromosome 6p21.3-p22. Genomics . 27 : 200—203. PMID 7665172 DOI :10.1006/geno.1995.1026
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші