OTX1

OTX1
Ідентифікатори
Символи	OTX1, orthodenticle homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600036 MGI: 97450 HomoloGene: 7875 GeneCards: OTX1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • diencephalon morphogenesis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • metencephalon development • forebrain development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • inner ear morphogenesis • midbrain development • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5013	18423
Ensembl	ENSG00000115507	ENSMUSG00000005917
UniProt	P32242	P80205
RefSeq (мРНК)	NM_001199770 NM_014562	NM_011023
RefSeq (білок)	NP_001186699 NP_055377	NP_035153
Локус (UCSC)	Хр. 2: 63.05 – 63.06 Mb	Хр. 11: 21.94 – 21.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTX1 (англ. Orthodenticle homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 37 327.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMSYLKQPPY		GMNGLGLAGP		AMDLLHPSVG		YPATPRKQRR		ERTTFTRSQL
DVLEALFAKT		RYPDIFMREE		VALKINLPES		RVQVWFKNRR		AKCRQQQQSG
SGTKSRPAKK		KSSPVRESSG		SESSGQFTPP		AVSSSASSSS		SASSSSANPA
AAAAAGLGGN		PVAAASSLST		PAASSIWSPA		SISPGSAPAS		VSVPEPLAAP
SNTSCMQRSV		AAGAATAAAS		YPMSYGQGGS		YGQGYPTPSS		SYFGGVDCSS
YLAPMHSHHH		PHQLSPMAPS		SMAGHHHHHP		HAHHPLSQSS		GHHHHHHHHH
HQGYGGSGLA		FNSADCLDYK		EPGAAAASSA		WKLNFNSPDC		LDYKDQASWR
FQVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Larsen K.B., Lutterodt M., Rath M.F., Moeller M. (2009). Expression of the homeobox genes PAX6, OTX2, and OTX1 in the early human fetal retina. Int. J. Dev. Neurosci. 27: 485—492. PMID 19414065 DOI:10.1016/j.ijdevneu.2009.04.004
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 2