GLIS2

GLIS2
Ідентифікатори
Символи	GLIS2, NKL, NPHP7, GLIS family zinc finger 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608539 MGI: 1932535 HomoloGene: 12821 GeneCards: GLIS2
Пов'язані генетичні захворювання
nephronophthisis 7
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро • non-motile cilium Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of smoothened signaling pathway • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • нейробіологія розвитку • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cell differentiation involved in kidney development • positive regulation of protein localization to nucleus • розвиток нирки • central nervous system development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84662	83396
Ensembl	ENSG00000126603 ENSG00000274636	ENSMUSG00000014303
UniProt	Q9BZE0	Q8VDL9
RefSeq (мРНК)	NM_032575 NM_001318918	NM_031184
RefSeq (білок)	NP_001305847 NP_115964	NP_112461
Локус (UCSC)	Хр. 16: 4.31 – 4.34 Mb	Хр. 16: 4.41 – 4.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GLIS2 (англ. GLIS family zinc finger 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 524 амінокислот, а молекулярна маса — 55 689.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHSLDEPLDL		KLSITKLRAA		REKRERTLGV		VRPRALHREL		GLVDDSPTPG
SPGSPPSGFL		LNSKFPEKVE		GRFSAAPLVD		LSLSPPSGLD		SPNGSSSLSP
ERQGNGDLPP		VPSASDFQPL		RYLDGVPSSF		QFFLPLGSGG		ALHLPASSFL
TPPKDKCLSP		DLPLPKQLVC		RWAKCNQLFE		LLQDLVDHVN		DYHVKPEKDA
GYCCHWEGCA		RHGRGFNARY		KMLIHIRTHT		NEKPHRCPTC		SKSFSRLENL
KIHNRSHTGE		KPYVCPYEGC		NKRYSNSSDR		FKHTRTHYVD		KPYYCKMPGC
HKRYTDPSSL		RKHIKAHGHF		VSHEQQELLQ		LRPPPKPPLP		APDGGPYVSG
AQIIIPNPAA		LFGGPGLPGL		PLPLAPGPLD		LSALACGNGG		GSGGGGGMGP
GLPGPVLPLN		LAKNPLLPSP		FGAGGLGLPV		VSLLAGAAGG		KAEGEKGRGS
VPTRALGMEG		HKTPLERTES		SCSRPSPDGL		PLLPGTVLDL		STGVNSAASS
PEALAPGWVV		IPPGSVLLKP		AVVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Zhang F., Jetten A.M. (2001). Genomic structure of the gene encoding the human GLI-related, Kruppel-like zinc finger protein GLIS2. Gene. 280: 49—57. PMID 11738817 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00764-8
• Kim Y.-S., Kang H.S., Jetten A.M. (2007). The Kruppel-like zinc finger protein Glis2 functions as a negative modulator of the Wnt/beta-catenin signaling pathway. FEBS Lett. 581: 858—864. PMID 17289029 DOI:10.1016/j.febslet.2007.01.058
• Lamar E., Kintner C., Goulding M. (2001). Identification of NKL, a novel Gli-Kruppel zinc-finger protein that promotes neuronal differentiation. Development. 128: 1335—1346. PMID 11262234

Див. також

• Хромосома 16