Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
FOXN1
Ідентифікатори
Символи
FOXN1 , FKHL20, RONU, WHN, forkhead box N1, TIDAND, TLIND
Зовнішні ІД
OMIM : 600838 MGI: 102949 HomoloGene: 2664 GeneCards: FOXN1
Пов'язані генетичні захворювання
T-cell immunodeficiency, congenital alopecia, and nail dystrophy [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• hair follicle development • defense response • nail development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • thymus epithelium morphogenesis • thymus development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • lymphocyte homeostasis • positive regulation of hair follicle development • epithelial cell proliferation • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of positive thymic T cell selection • keratinocyte differentiation • lymphoid lineage cell migration into thymus • T cell homeostasis • multicellular organism development • regulation of T cell differentiation in thymus • epidermis development • animal organ morphogenesis • регуляція експресії генів • проліферація • T cell lineage commitment • positive regulation of epithelial cell differentiation • диференціація клітин • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • кровотворення
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 28.51 – 28.54 Mb
Хр. 11: 78.25 – 78.28 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
FOXN1 (англ. Forkhead box N1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 648 амінокислот , а молекулярна маса — 68 925[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MVSLPPPQSD VTLPGPTRLE GERQGDLMQA PGLPGSPAPQ SKHAGFSCSS
FVSDGPPERT PSLPPHSPRI ASPGPEQVQG HCPAGPGPGP FRLSPSDKYP
GFGFEEAAAS SPGRFLKGSH APFHPYKRPF HEDVFPEAET TLALKGHSFK
TPGPLEAFEE IPVDVAEAEA FLPGFSAEAW CNGLPYPSQE HGPQVLGSEV
KVKPPVLESG AGMFCYQPPL QHMYCSSQPP FHQYSPGGGS YPIPYLGSSH
YQYQRMAPQA STDGHQPLFP KPIYSYSILI FMALKNSKTG SLPVSEIYNF
MTEHFPYFKT APDGWKNSVR HNLSLNKCFE KVENKSGSSS RKGCLWALNP
AKIDKMQEEL QKWKRKDPIA VRKSMAKPEE LDSLIGDKRE KLGSPLLGCP
PPGLSGSGPI RPLAPPAGLS PPLHSLHPAP GPIPGKNPLQ DLLMGHTPSC
YGQTYLHLSP GLAPPGPPQP LFPQPDGHLE LRAQPGTPQD SPLPAHTPPS
HSAKLLAEPS PARTMHDTLL PDGDLGTDLD AINPSLTDFD FQGNLWEQLK
DDSLALDPLV LVTSSPTSSS MPPPQPPPHC FPPGPCLTET GSGAGDLAAP
GSGGSGALGD LHLTTLYSAF MELEPTPPTA PAGPSVYLSP SSKPVALA
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші