Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXA11
Ідентифікатори
Символи
HOXA11 , HOX1, HOX1I, RUSAT1, homeobox A11
Зовнішні ІД
OMIM : 142958 MGI: 96172 HomoloGene: 4033 GeneCards: HOXA11
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • protein-DNA complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis • skeletal system development • proximal/distal pattern formation • regulation of chondrocyte differentiation • male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • organ induction • anatomical structure morphogenesis • embryonic digit morphogenesis • transcription, DNA-templated • single fertilization • uterus development • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • branching involved in ureteric bud morphogenesis • developmental growth • embryonic limb morphogenesis • positive regulation of chondrocyte differentiation • Сперматогенез • positive regulation of cell development • регуляція експресії генів • embryonic skeletal joint morphogenesis • metanephros development • mesodermal cell fate specification • dorsal/ventral pattern formation • embryonic forelimb morphogenesis • anterior/posterior pattern specification • bone development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 27.18 – 27.19 Mb
Хр. 6: 52.22 – 52.22 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HOXA11 (англ. Homeobox A11 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот , а молекулярна маса — 34 486[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDFDERGPCS SNMYLPSCTY YVSGPDFSSL PSFLPQTPSS RPMTYSYSSN
LPQVQPVREV TFREYAIEPA TKWHPRGNLA HCYSAEELVH RDCLQAPSAA
GVPGDVLAKS SANVYHHPTP AVSSNFYSTV GRNGVLPQAF DQFFETAYGT
PENLASSDYP GDKSAEKGPP AATATSAAAA AAATGAPATS SSDSGGGGGC
RETAAAAEEK ERRRRPESSS SPESSSGHTE DKAGGSSGQR TRKKRCPYTK
YQIRELEREF FFSVYINKEK RLQLSRMLNL TDRQVKIWFQ NRRMKEKKIN
RDRLQYYSAN PLL
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Potter S.S., Branford W.W. (1998). Evolutionary conservation and tissue-specific processing of hoxa 11 antisense transcripts. Mamm. Genome . 9 : 799—806. PMID 9745033 DOI :10.1007/s003359900870
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Thompson A.A., Nguyen L.T. (2000). Amegakaryocytic thrombocytopenia and radio-ulnar synostosis are associated with HOXA11 mutation. Nat. Genet . 26 : 397—398. PMID 11101832 DOI :10.1038/82511
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші