Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
KLF13
Ідентифікатори
Символи
KLF13 , BTEB3, FKLF2, NSLP1, RFLAT-1, RFLAT1, Kruppel-like factor 13, Kruppel like factor 13
Зовнішні ІД
OMIM : 605328 MGI: 1354948 HomoloGene: 32288 GeneCards: KLF13
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of erythrocyte differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 15: 31.33 – 31.44 Mb
Хр. 7: 63.54 – 63.59 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
KLF13 (англ. Kruppel like factor 13 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 288 амінокислот , а молекулярна маса — 31 180[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAAAAYVDHF AAECLVSMSS RAVVHGPREG PESRPEGAAV AATPTLPRVE
ERRDGKDSAS LFVVARILAD LNQQAPAPAP AERREGAAAR KARTPCRLPP
PAPEPTSPGA EGAAAAPPSP AWSEPEPEAG LEPEREPGPA GSGEPGLRQR
VRRGRSRADL ESPQRKHKCH YAGCEKVYGK SSHLKAHLRT HTGERPFACS
WQDCNKKFAR SDELARHYRT HTGEKKFSCP ICEKRFMRSD HLTKHARRHA
NFHPGMLQRR GGGSRTGSLS DYSRSDASSP TISPASSP
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Song A., Chen Y.F., Thamatrakoln K., Storm T.A., Krensky A.M. (1999). RFLAT-1: a new zinc finger transcription factor that activates RANTES gene expression in T lymphocytes. Immunity . 10 : 93—103. PMID 10023774 DOI :10.1016/S1074-7613(00)80010-2
Cook T., Gebelein B., Urrutia R. (1999). Sp1 and its likes: biochemical and functional predictions for a growing family of zinc finger transcription factors. Ann. N. Y. Acad. Sci . 880 : 94—102. PMID 10415854 DOI :10.1111/j.1749-6632.1999.tb09513.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші