Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HLF
Ідентифікатори
Символи
HLF , PAR bZIP transcription factor, HLF transcription factor, PAR bZIP family member
Зовнішні ІД
OMIM : 142385 MGI: 96108 HomoloGene: 31074 GeneCards: HLF
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • double-stranded DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • skeletal muscle cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • ритмічний процес • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 55.26 – 55.33 Mb
Хр. 11: 90.23 – 90.28 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
HLF (англ. HLF, PAR bZIP transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 295 амінокислот , а молекулярна маса — 33 199[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEKMSRPLPL NPTFIPPPYG VLRSLLENPL KLPLHHEDAF SKDKDKEKKL
DDESNSPTVP QSAFLGPTLW DKTLPYDGDT FQLEYMDLEE FLSENGIPPS
PSQHDHSPHP PGLQPASSAA PSVMDLSSRA SAPLHPGIPS PNCMQSPIRP
GQLLPANRNT PSPIDPDTIQ VPVGYEPDPA DLALSSIPGQ EMFDPRKRKF
SEEELKPQPM IKKARKVFIP DDLKDDKYWA RRRKNNMAAK RSRDARRLKE
NQIAIRASFL EKENSALRQE VADLRKELGK CKNILAKYEA RHGPL
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біологічні ритми, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші