Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MXD3
Ідентифікатори
Символи
MXD3 , BHLHC13, MAD3, MYX, MAX dimerization protein 3
Зовнішні ІД
OMIM : 609450 MGI: 104987 HomoloGene: 32333 GeneCards: MXD3
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein dimerization activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес
• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 5: 177.3 – 177.31 Mb
Хр. 13: 55.47 – 55.48 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
MXD3 (англ. MAX dimerization protein 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 206 амінокислот , а молекулярна маса — 23 477[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEPLASNIQV LLQAAEFLER REREAEHGYA SLCPHRSPGP IHRRKKRPPQ
APGAQDSGRS VHNELEKRRR AQLKRCLERL KQQMPLGADC ARYTTLSLLR
RARMHIQKLE DQEQRARQLK ERLRSKQQSL QRQLEQLRGL AGAAERERLR
ADSLDSSGLS SERSDSDQEE LEVDVESLVF GGEAELLRGF VAGQEHSYSH
GGGAWL
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші