Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MTA2
Ідентифікатори
Символи
MTA2 , MTA1L1, PID, metastasis associated 1 family member 2
Зовнішні ІД
OMIM : 603947 MGI: 1346340 HomoloGene: 3480 GeneCards: MTA2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • histone deacetylase binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleosomal DNA binding • histone deacetylase activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity
Клітинна компонента
• histone deacetylase complex • NuRD complex • мембрана • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Метилювання ДНК • regulation of fibroblast migration • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 11: 62.59 – 62.6 Mb
Хр. 19: 8.92 – 8.93 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MTA2 (англ. Metastasis associated 1 family member 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 668 амінокислот , а молекулярна маса — 75 023[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAANMYRVGD YVYFENSSSN PYLVRRIEEL NKTANGNVEA KVVCLFRRRD
ISSSLNSLAD SNAREFEEES KQPGVSEQQR HQLKHRELFL SRQFESLPAT
HIRGKCSVTL LNETDILSQY LEKEDCFFYS LVFDPVQKTL LADQGEIRVG
CKYQAEIPDR LVEGESDNRN QQKMEMKVWD PDNPLTDRQI DQFLVVARAV
GTFARALDCS SSIRQPSLHM SAAAASRDIT LFHAMDTLQR NGYDLAKAMS
TLVPQGGPVL CRDEMEEWSA SEAMLFEEAL EKYGKDFNDI RQDFLPWKSL
ASIVQFYYMW KTTDRYIQQK RLKAAEADSK LKQVYIPTYT KPNPNQIISV
GSKPGMNGAG FQKGLTCESC HTTQSAQWYA WGPPNMQCRL CASCWIYWKK
YGGLKTPTQL EGATRGTTEP HSRGHLSRPE AQSLSPYTTS ANRAKLLAKN
RQTFLLQTTK LTRLARRMCR DLLQPRRAAR RPYAPINANA IKAECSIRLP
KAAKTPLKIH PLVRLPLATI VKDLVAQAPL KPKTPRGTKT PINRNQLSQN
RGLGGIMVKR AYETMAGAGV PFSANGRPLA SGIRSSSQPA AKRQKLNPAD
APNPVVFVAT KDTRALRKAL THLEMRRAAR RPNLPLKVKP TLIAVRPPVP
LPAPSHPAST NEPIVLED
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Luo J., Su F., Chen D., Shiloh A., Gu W. (2000). Deacetylation of p53 modulates its effect on cell growth and apoptosis. Nature . 408 : 377—381. PMID 11099047 DOI :10.1038/35042612
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Cong L., Pakala S.B., Ohshiro K., Li D.Q., Kumar R. (2011). SUMOylation and SUMO-interacting motif (SIM) of metastasis tumor antigen 1 (MTA1) synergistically regulate its transcriptional repressor function. J. Biol. Chem . 286 : 43793—43808. PMID 21965678 DOI :10.1074/jbc.M111.267237
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші